O Eixo 2 do Subprograma FIPPE, o Monitoramento e Controle do Desmatamento, Queimadas e Incêndios Florestais integrou as ações de execução direta do Programa REM MT. O conceito e o foco central dessa atuação basearam-se em manter e recuperar a cobertura florestal e seus serviços ecossistêmicos em Mato Grosso, promovendo a redução do desmatamento e de queimadas ilegais com a consequente responsabilização dos infratores. A governança e a operacionalização do eixo apoiaram-se em uma forte articulação interinstitucional envolvendo órgãos ambientais, de planejamento e de segurança pública para a execução integrada de planos de ação de comando e controle.

Para estruturar e modernizar a capacidade de combate aos ilícitos ambientais, o plano metodológico dividiu-se no apoio às bases para regularização ambiental e no aprimoramento tecnológico e operacional dos sistemas de fiscalização. No campo da regularização, o trabalho focou no monitoramento remoto de passivos ambientais, termos de compromisso e na definição de procedimentos para o avanço do cadastro ambiental rural. Paralelamente, o fortalecimento institucional envolveu investimento em geotecnologia e modernização metodológica, resultando em avanços expressivos na fiscalização remota, aquisição de equipamentos e mobiliários, integração de bancos de dados geocodificados e emissão contínua de alertas semanais de desmatamento, além da pesquisa, e divulgação do novo Mapa de Vegetação Primária do Estado de Mato Grosso. As ações abrangeram as esferas administrativa, cível e criminal, impulsionando a celeridade e a eficiência de processos eletrônicos de responsabilização em parceria com forças policiais, o Ministério Público e a SEMA-MT.